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WSSにもアカウント作成の機能はあるのですが、Codenameではオリジナルを実装しています。

アカウントの作成・管理のページ自体はWSSなのですが、Webパーツのページビューアーを使用して、独自のWebアプリケーションを表示しています。

作成方法としましては、WSSやExchange、ActiveDirectoryに対していわゆるプロビジョニングといったものを行う必要があります。
プログラムに関する情報としましては、各サーバーアプリケーションのSDKや、マイクロソフトKBなどが参考になります。